プロローグ
限りなく深い闇・・・・。暗黒銀河。
その未知なる領域に再び黒い生命が誕生した。
ダーク・フォース・・・・、破壊神バクテリアンは、想像を絶するエネルギーで全宇宙を包み込み殺戮を始めた。
侵略の魔の手はグラディウス周辺の惑星をも次々と飲み込み、母なるグラディウスにも刻々と、その危機が迫る。
グラディウス連邦政府の敷く一大包囲網は、かつてないほど強大なダーク・フォースを前にもろくも崩れ去ろうとしている。
超時空ファイタービックバイパー
いま、全宇宙の命運をかけ、果てしない闇の彼方へ
再び、飛び立つ・・・・。